·  贺克斌教授等完成的“大气颗粒物及其前体物排放与复合污染特征”项目获国家自然科学奖二等奖

·  黄霞教授等完成的“低能耗膜－生物反应器污水资源化新技术与工程应用”项目获国家科学技术进步奖二等奖

·  “环境科学与工程实验实践教学中心”入选2009年度国家级实验教学示范中心建设单位

·  主办第三届全国环境学科建设研讨会

·  环境系教师参加联合国气候变化大会

·  主办第二届中韩持久性有机污染物研讨会

·  《环境监测》入选国家级精品课程

·  清华环境系与法国威立雅集团共同举办环境与城市管理高级研修项目（第一期）

·  主办第六届环境模拟与污染控制学术研讨会

·  主办国际厌氧生物先进技术研讨会

·  环境系学生课外科创作品获第十一届“挑战杯”全国大学生课外学术科技作品竞赛二等奖

·  主办第四届固体废物管理与技术国际会议

 ·  钱易院士获世界工程组织联合会2009年优秀工程教育奖

 ·   环境系学生参加国庆60周年群众游行、广场联欢和复兴之路演出等活动

 ·  环境系学生黄悦等在“中日韩青少年环保创意作品展”上为温家宝总理介绍三国青少年利用废旧物品制作的环保作品。

 ·  主办第三届环境学科全国博士生学术会议

 ·  与德国乌帕塔尔气候环境与能源研究院签署合作备忘录

 ·  主办第三届中瑞环境与可持续发展研讨会

 ·  承办全国给水深度处理研究会2009年年会

· 钱易院士获2009年“清华大学突出贡献奖”

·  Frontiers of Environmental Science & Engineering in China自2009年1月被SCI收录，成为清华大学第一本被SCI收录的英文刊物

· 意大利环境领土和海洋部部长访问环境系

· 清华－苏伊士环境联合成立环境科学与工程实验实践教学中心

· “践行可持续发展理念，创建大学绿色教育体系”荣获北京市教学成果特等奖

· 龙峰论文入选2009年北京市优秀博士学位论文

· 第23次教育工作研讨会环境系系列活动正式启动

· 《科学》杂志封面文章发表哈佛大学与环境系合作研究成果

· 与国际水协联合举办2009国际水协第五届膜技术大会

· 与苏州市政府联合主办2009中国城市循环经济发展论坛           

· 研究成果“彗星式纤维滤料及应用”荣获第十八届全国发明展览会金奖

· 校党委书记胡和平带队到环境系调研

· “环境科学与工程实验实践教学中心”被评为北京市实验教学示范中心

· 黄霞教授入选教育部长江学者奖励计划特聘教授

· 清华大学（环境科学与工程系）中国循环经济产业研究中心成立

· 主办曲格平先生八十华诞暨从事环境保护四十年庆贺会

· “固体废物资源化及应急控制工程教育部重点实验室”建设计划通过教育部专家论证

· 依托环境系建立的“Basel公约亚太协调中心”获准为联合国环境规划署POPs公约区域中心

· 主办“持久性有机污染物论坛2009暨第四届全国持久性有机污染物学术研讨会”

· 开办中国光大国际有限公司工程硕士班

· 各届系友齐聚环境系共庆清华大学98周年华诞暨环境系建系25周年

· “环境科学与工程实验实践教学中心”被评为校一级实验室

· 第四届清华大学环境友好科技竞赛启动

· 井文涌教授荣获“香港环境保护协会全国人物环保成就奖”

· 举办河北省环保系统环境管理高级研修班

· 深入学习实践科学发展观系列活动正式启动

· 清华大学（环境科学与工程系）—山东十方环境与生物能源工程研发中心成立

· 主办第二届中国环境投资大会

· 常务副校长陈吉宁任“水体污染控制与治理”科技重大专项技术副总师

· 环境系承担“水专项”城市水环境主题中“环太湖河网地区城市水环境整治技术研究与综合示范”项目

· 举办山西省环保局领导干部环境管理高级研修班