人才队伍建设基金

2020年设立，旨在支持环境学院的人才队伍建设。该基金主要由清华苏州环境创新研究院、北京国环清华环境工程设计研究院有限公司等捐赠。

清华大学老牛环境基金

2012年由老牛基金会捐赠，旨在支持清华大学环境学院的建设和发展，培养环境领域具有国际视野的拔尖创新人才。

钱易环境教育基金

2016年由钱易院士的学生捐赠，期望以此培养更多环保人才，该基金设有钱易环境奖学金，奖励全国环境领域优秀学生。

环境发展基金

2019年由清华大学环境学院设立，旨在推动学院教育事业的蓬勃发展。捐赠主要来自国内外企业、社会团体、校友、个人捐赠等。